基本健康防护
公卫师公会指出，灾后应注意饮用水与食品安全。洪水可能污染水源，居民应使用煮沸后的水或瓶装水，并丢弃受浸泡食材。清理淤泥须穿戴防护装备，避免皮肤接触污染水体，以降低肠胃道疾病及钩端螺旋体感染风险。同时，潮湿环境易导致霉菌滋生，需保持室内通风并淘汰发霉家具，特别注意老人与儿童呼吸健康。积水容器应及时清除，并配合地方政府防疫措施，以避免登革热等传染病扩散。
此外，公会提醒，灾后压力可能引发焦虑、失眠与创伤反应，应设立心理健康咨询站，并透过社区互助支持系统降低长期影响。
泥流型灾害的环境污染风险
公会指出，泥流型灾害与一般水灾不同，挟带大量土石与沉积物，可能造成潜在污染。虽目前并无确切证据显示花莲灾区已有严重化学物质或重金属污染，但基于台湾地质特性与国际灾害经验，建议应采取风险预防原则。
公会说明，台湾山区岩层天然可能含有砷、铅、镉等微量元素，土石崩落后可能随泥沙沉积于农地或河川。泥流若通过农耕地或是工厂，可能夹带农药、肥料残留与工厂的油料或化学品，则存在潜在污染风险。
例如，九二一地震后，部分土石流沉积物检测显示重金属浓度升高；日本2018年豪雨及土耳其洪水，也曾发生洪水后泥沙含重金属或农业化学物质的情况。
建议防范措施
公会建议，环保与农业主管机关，应立即进行水质与土壤检测，确认农地与水源安全。检测结果出炉前，居民应避免使用受淤泥覆盖农地种植食物，井水及地下水亦应避免直接饮用。而检测结果应及时公开，让居民能安心、正确规划后续重建与农业复耕。
志工健康提醒
公会也提醒，参与清理与重建工作的志工、医护与军警消防人员，因长时间暴露于泥水、粉尘与霉菌环境，需佩戴口罩（建议N95）、防水手套与靴子，并及时更换被污染衣物。另外，高强度的搬运与清理工作易造成肌肉骨骼伤害，应安排轮班，避免长时间劳动。若出现发烧、腹泻、皮肤红肿或呼吸困难，应立即就医，避免延误病情。
此外，协助灾区工作者，可能面临压力或次级创伤反应，应建立心理支持管道，鼓励表达情绪并互相支持。
公会强调，潜在污染风险并非代表灾区已有污染，而是基于公共卫生的预防性立场。唯有在重建过程中，同步守护居民与协助者的健康，落实饮水安全、环境检测、病媒防治与心理支持，社区才能真正恢复安全与健康。
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