根据疾管署长庄人祥的推估，从5月底到8月初，全台可能将有高达170万人次因新冠就医，高峰期可能落在6月底到7月初，单周就医人数甚至超过20万人。医界担心补助减少会影响基层打疫苗的积极度，进而加剧疫情扩散，呼吁政府尽快改善补助制度，否则难以鼓励第一线人员投入防疫工作。
不只疫苗补助减少，基层医师也指出，快筛补助从300元砍到150元，加上还得面对被感染的风险，让医护人员叫苦连天。罗一钧说，目前每种公费疫苗的施打处置费统一是100元，之前新冠疫苗补助200元，是因为有临时加码，指挥中心解编后已恢复常态。卫福部也正研议提升整体补助标准，让医护能有更多诱因投入防疫。
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为了解决基层困境，卫福部在5月6日立法院公听会后，邀请医师公会、诊所协会、感染症与急诊学会等团体召开研商会议，由邱泰源部长亲自主持。会中针对疫苗与药物配置、快筛供应、分流就医等议题讨论，并下令全力协助基层防疫。食药署表示目前快筛供货稳定，每周可出货4.5万剂，健保署也开放各界提案，检讨快筛补助点值。
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