小儿科医师施胜桓指出，近期不论是口服克流感，还是急诊常用的针剂抗病毒药物，疗效都显著下降，「以前吃药退烧很快，现在大约有10%至20%的病人会反复发烧，治疗效果确实不如过去。」
对此，疾管署29日出面回应，根据监测资料，今年检出的A型H1N1病毒株中，约有6.5%带有抗药性突变，比去年的3.2%略高。但目前社区流行的病毒株已转为A型H3N2，占比超过一半，且未检出抗药性；至于B型流感与另一种口服抗病毒药「纾伏效锭」也都没有抗药性问题。
疾管署强调，抗药性主要集中在A型H1N1，影响相对有限，加上9月后H1N1比例持续下降，疫情风险可控。署方也宣布，10月1日起公费抗病毒药物将扩大适用，凡是出现类流感症状的特定族群，经医师评估后无需快筛即可使用；公费流感疫苗同日开打，将进一步降低重症风险。
疾管署呼吁，民众不要小看流感威力，平时要勤洗手、注意呼吸道卫生，有发烧或咳嗽症状应戴口罩并及早就医，并在家休息避免传染他人。相关药物使用规范、合约医疗院所名单及流感资讯，可上疾管署官网或拨打1922专线查询。
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