党内矛盾爆发
第二波罢免投票失利后，民进党立院党团矛盾彻底引爆。24日，干事长吴思瑶、书记长陈培瑜、副书记长郭昱晴、林月琴、副干事长林楚茵相继表态辞职，王义川也宣布不再续任副干事长。吴思瑶甚至直言，柯建铭多次打电话慰留，但她「都不敢接」。
批判声浪接连而至。郭国文率先发难，直指柯建铭「假传圣旨、忽视意见」；林淑芬则痛批「党团毫无讨论，直接下达命令，还威胁跑票者开除」；赖瑞隆表态支持「全面改选」；林俊宪也说，改组已成党内共识。素来与柯对立的王世坚，更在罢免失败后送他一包卫生纸，要他「自己擦屁股」。
但也并非所有人都选边倒戈。苏巧慧被问及柯是否该下台时回应，柯的经验与资历是党的重要资产，「其实无人可以取代」；前立委郑运鹏也声援说，「帮忙乔事情的人，难免遇到争议，这时候又嫌他形象不好，这样怎么办呢？」、「何必对柯总召那么刻薄？」
柯建铭本人面对逼宫仍旧未表退意，并以「七步诗」回应：「大罢免是穷尽一切可能让国会过半，何错之有？难道罢团也错了吗？」
「万年总召」的崛起与包袱
柯建铭熟稔议事规则、法案功力深厚，历经陈水扁时代跛脚执政、马英九执政时的在野困境，也在蔡英文任内的完全执政中担任关键角色，因而获「万年总召」之名。他的著作《大局，承担》中，苏贞昌赞赏柯「能与各方交好，既能挑战国民党，又能沟通互动」、「政治必须耐烦、耐辱，他甚至还能耐操」。蔡英文也回忆，2008年民进党仅27席立委时，柯总召靠灵活战术与专业问政，让少数党声音极大化，「这样的功力，党内实在不做第二人想」。然而，随著国会生态改变，柯建铭的「老派总召」模式也面临挑战。
钟佳滨呼吁「重启新局」 引柯建铭名言提醒自己
民进党立委钟佳滨提醒，抓战犯无助解决问题，重点是「重启新局」，先确立党团方向与目标，再谈人事调整。他说，「至少要清楚党团自己的定位，不然如何前进？难道处理掉战犯，战败就不见了吗？」。
钟佳滨忆及，柯建铭过去很柔软，能与蓝营的费鸿泰、王金平谈判，甚至能配合任何干事长，被各派系接受，柯曾说，「我当总召，谁当干事长我都可以配合」，表示柯建铭有弹性，能与任何人合作。
钟佳滨指出，柯建铭的黄金时代是与马英九执政时的立法院长王金平谈判。他坦言，「跳探戈，是两人要有差不多的功力，若两人功力不相称，探戈也跳得不漂亮，老柯现在可能找不到一个可以与他跳探戈的人」。
钟佳滨回忆柯建铭曾说过：「国会的少数派唯有透过谈判，才有可能取得略大于己方实力的成果，一味的杯葛到底、破坏，甚至拒绝谈判，只会让少数派一事无成，输到脱裤子」，如今，这句话也像是在提醒柯建铭自己。
学界分析：没人能接班老柯
东吴大学政治系助理教授陈方隅指出，民进党最大困境在于「没有人能取代柯建铭」。整个党团乃至政策协调，几乎全靠「老柯系统」。若此刻换人，恐难有人接得上。
但他也批评，柯建铭对现况判断失准。蓝白阵营如今采「坚壁清野、全面拖垮」战术，而立法院长韩国瑜在国会失去功能，很少主持协商、又不主导议事，议程反由国民党立委傅崐萁、翁晓玲主导，「这让老柯难以接受，他也没有认清国会已经是四处放火、不讲理的局面」。
目前党内传出有意拱出前副院长蔡其昌接任总召，但蔡其昌仅回应「总召改选要到明年二月，没有什么好回答的」，即使被问是否愿意承担，他也仅说「承担是大家需要你，才有你承担的问题，这不是我能回答的」；至于被点名接任干事长的苏巧慧，则婉拒表示「党内比我适合的人很多」。
陈方隅认为，以资历来看，蔡其昌、庄瑞雄都有能力承担，但可能还要面临党内人和与派系问题，而「柯建铭之后」的局面，仍是民进党最严峻的考验。
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