检方指出，许芷瑜不仅是柯文哲贴身幕僚，地位甚至重要到还需负责处理金流，像是博弈大亨陈盈助左右手邱清章曾丢在市长办公室地上的300万元，以及威京集团主席沈庆京1500万元贿款等，且甚至直呼：「1500万不会很重，一个女生可以搬得起来。」
检方进一步说明，新故乡基金会秘书长苏进强2024年4月间透过名嘴吴子嘉介绍，由觉悟妙天禅师捐款1000万元给柯文哲，当时柯文哲亲自登门拜访后便拉走妙天所交付的这卡皮箱、里头装满了1000万元现金，而检方事后也查出柯文哲已将钱交给许芷瑜处理，并被李文宗证称她都是用手提袋装著一捆一捆现金、每捆10万元，直到交给自己或胞妹李文娟后再转交给苏进强。
针对1000万元捐款部分，柯文哲强调新故乡基金会是由苏进强所成立、并自己去向妙天募款的，当时他去找妙天时，对方给了他一卡皮箱，而许芷瑜也只是负责拖箱子、不保管钱，「当时我不好意思打开来看里面到底有多少钱，箱子拖回去就交给李文宗了。」
检方直言，像许芷瑜这种需帮忙处理上百上千万金流的人，在柯文哲身边绝非等闲之辈，不过如今他因对方恐衍生串证风险才把人赶出国，制造风险的人则得承担风险；对此，柯文哲解释：「橘子只是随行秘书，没有安排我的行程」，并感叹：「检察官实在是太夸大橘子的角色了。」
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