根据农业部统计，农作物损失总额高达6亿9486万元，受害面积达9067公顷，平均损害程度为30%，相当于有2750公顷农地收成全失。损失最严重的作物依序为香蕉、文旦柚、竹笋、柳橙及椪柑。其中香蕉受灾面积1098公顷，损失达1亿3022万元；文旦柚损失也有1亿2107万元。
在县市灾损部分，目前以嘉义县最严重，损失达4亿7755万元，占全台损失近一半，其次是台南市2亿6053万元、云林县2亿4566万元、屏东县1082万元。此外，畜产部分也损失1035万元，以鸡只死亡最为明显；渔业损失则有1亿8375万元，其中牡蛎养殖损害最大。
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民间农业设施部分，损失总计约1亿1631万元，主要集中在温室、塑胶布设施及畜舍等建筑。农业部表示，未来将持续汇整各地灾情，并研拟后续补助与复耕计划，协助农民早日恢复生产。
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