星期日有媒体爆出「请辞获准」，陈吉仲8月底尚未萌生辞意，但随砲火猛攻，为减少农业部被砲轰，他多次提出请辞，虽被挽留下来，他直言「抹黑有多可恶，要回应都要去找根据，字字斟酌，抹黑成本很低，随便写一个，要选举的民意代表又乱讲，媒体又发酵，每一个澄清怎么比的上抹黑造谣的速度」。
包含50万资本、图利超市等议题，而农业部收集证据有时候要去调，要请业者配合才能呈现，当拿出证据后，就转移议题、转移战场，打击力道越来越大，这也让他体验到，台湾是一个民主自由的国家，每个人都有自由，但是面对这样排山倒海抹黑的状况，真的要有可以因应跟解决的方式，否则「专业」不见了就很麻烦。
最后还是要坚持离开的理由，就是因为如果没有他请辞，农业部大概会因为他个人的因素被定型化，刚好搭配议题太容易被攻击，所以真的感谢最后总统、院长愿意让我走。
周日「请辞获准」消息传出，传言是派系斗争，陈吉仲不这么认为，他没有任何党派，像是有同仁传给他讯息，他才知道说，「我怎么今天被规划为，比如说什么新潮流，然后一下子又被规划英系，开玩笑，我都跟每个农业县委员很好，我自己没有派系，而且我也不是民进党党员，我无党无派」。
他认为这个跟派系一点关系都没有，「我做人都要考虑别人」如果在这个位置，我就会很害羞，他坦白，在年初缺蛋的时候，他「非常难受，那一阵子很难受、很难受，而陈院长又很温柔，我更难受，陈院长没有跟我讲过一句因为缺蛋的责骂，他只请我赶紧解决」。
陈吉仲直言，2、3月是最难受的，跟现在一样，因为我没有把缺蛋解决，我无法接受自己没有做好，影响到其他人，那时候院长才刚上来，立法院也都问他很多缺蛋问题，他真的非常难受，只因他认为「我给人家影响到了，那我怎么有那个脸还在那里」在3月及4月开会讨论的时候有讲过请辞，可是那时候没办法走。
随缺蛋问题解决，现在也不是政策面的问题，是事情可以检讨的，因为蛋都进来，后面也都已经有长约、短约的制度在运作，现在是他个人影响到其他人，因此他辞意坚定。
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