根据卫福部规划，新制将把补充保费从目前的「即时扣缴」改为「年度结算」，并订出2万元所得为课征门槛。这样的设计，意在让补充保费更全面地纳入非薪资所得，例如定存利息、配发股利与房屋租金等，确保高资产者也能合理负担健保支出。
卫福部指出，健保改革的目标是让制度更稳健、更公平，但目前补充保费新制仍在研议阶段，尚未定案。卫福部表示，健保已实施30年，过去主要以薪资作为保费来源，但随著高龄化、少子化加剧，劳动人口从2015年的1700多万人逐年下降，如果只靠薪资缴费，年轻世代负担会越来越重，因此才提出多元缴费的想法。
连贤民在脸书发文表示，看到卫福部部长石崇良准备改革补充性保费的新闻，目前规画要将补充性保费由即时的就源扣缴，修法改成「年度结算」但下限维持两万，并优先从利息、股利、租金开始实施。此外，针对奖金部分，则将起征门槛从投保时薪资的4 倍以上，改成「最低基本工资x4倍」为标准，来增加高薪人士负担健保的公平性。这新闻一出，果然怨声连连，股民抱怨政府。
「这些抱怨是很可以预期的，也反映出健保财务改革的困难。」连贤明分析，关于这次改革有两点评论，第一，很多股民说，他们股票差价没有赚钱，为什么要针对股利课税? 自从二代健保后，健保收费改成类似个人总所得收费制度: 一般保费针对薪资所得，非薪资所得则归给补充性保费，所以股利课税是针因为股票所发放股利课税，就像股利所得要计入综所税一并计算一样，和股票有没有赚钱是两回事。国外股票差价赚钱要另外计入资本利得课税，台湾经历过几次证劵所得税课征失败，要真的课征证所税可能要再等15-20年。
连贤明接著说，第二，当初补充性保费设计时，政大健保研究团队也有参与。考量到行政成本，当初就建议采就源扣缴，并将单笔下限从两千五，五千，一万，两万为基础来试算。最后在行政成本和健保收入综合考量下，选择以两万做为下限的基础。部长在这次改革可采用类似方式，适当的提高年度结算的下限金额，并适度再提高单次扣缴的上限，抓大放小来降低改革的政治冲击。
最后，连贤明坦言，台湾已经很久不面对健保财务改革，每个政治人物都说健保很重要不能倒，然后健保涨保费都双手一摊说不要找我，最大共识就只有政府多出钱，这样健保财务永远没有解。
