柯文哲家祭致辞全文如下：
我的父亲柯承发，曾梦想和哥哥一样、念台大医学院、当悬壶济世的医师，却在14岁时遭遇二二八，我的祖父被抓走，在狱中被讯问、拷打三个星期，释放后卧床几年抑郁而终。祖父倒下后，下面还有好几个弟弟妹妹，所以父亲只能去读新竹师范学校，念书用公费、毕业后薪水都拿来供应弟弟妹妹成长。
没有机会当医生、也没有机会念大学是我父亲的遗憾，所以我小时候不用特别督促，也认真读书，父亲看著我的成绩单，虽然和平常一样没有多说甚么，但我知道他是高兴的。
虽然父亲的人生机会被当年的白色恐怖所剥夺，他还是努力地工作，他是柯家最坚强的支柱和靠山。
解严之后，228不再是社会禁忌，却变成我最尴尬的日子，每一年一到228，父亲参加完纪念活动，他就一路哭著回家，我知道，这是父亲一生都无法走出的阴影。这就是为什么每年228，我都去参加「一日北高」或「一日双塔」的自行车活动，我用汗水代替泪水，走出忧伤的情结，用正面阳光的方式去面对历史的悲情。
2013年，当我可能参选台北市长的消息开始传开，父亲从新竹搭车到台北，跑去台大医院劝我好好当医生，他说：「我在228失去父亲，我不要再失去儿子」。我最后的决定，让您这十年来为我操了不少心。我的人生这个转弯，更让您在临终前失去了儿子的陪伴。
去年八月，父亲正在住院时，我因为各种司法罗织的罪名遭到搜索、羁押，身为一个急重症医师，行医30多年，我竟然我无法在父亲需要我时亲自照料、为父亲的病情做处置，只能在父亲发出病危通知时，在重重戒护下被带到医院。
前两次，父亲还努力的睁开眼睛，看我一眼，结果两次都奇迹似的好转，我知道他一直撑著要等我出狱，但我却只能短短的停留半小时。每一次离开，我都以为就是永别。第三次，我又在半夜一点被带到新竹分院，我看著父亲，想叫他，却发不出声，因为当时父亲尿毒素（BUN）超过160，每天尿量只有30c.c.，人已经完全昏迷，我只能静静的流泪、轻轻握著他的手，这时候，说什么，他也听不到了。
我知道父亲一直在等我，他以九十四岁的高龄，以这样的病体强撑了六个多月，直到他的身体再也无法负荷。我却再度让父亲失望，最后还是无法在最后一刻随侍在旁、无法再握著父亲的手，告诉他我的感谢、更无法向他拜别。连父亲过世的消息，都是隔了一天，才由律师转达，当律师告诉我：「你爸爸在昨天去世了」，那悬在心中好几天的不安终于发生了，父亲终于撑不到我可以回去陪伴他，这是我一生的遗憾。
人间至悲、莫此为甚。
父亲，感谢您这一生对我的严厉教诲、对我关怀备至，谢谢您尽管不认同我从政、期待我安稳的在台大医院当个医生，但谢谢您，总是静静的在每一个场合支持著我、当儿子最大的靠山。
对不起父亲！直到我60多岁了，还让你如此担心，请父亲安息吧！您的儿子会像您一样，继续坚强的面对人生的挫折和打击，请您不要为我担心。在天之灵，请庇佑著妈妈，保佑她身体康健，我以后会好好的照顾妈妈。
我相信，苦难都会过去，总有重现光明的一天，
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