雄检陈彦竹主任检察官、许萃华检察官知情后，指挥保安警察第七总队第三大队、调查局高雄市调查处及高雄市警局林园分局、凤山分局等单位组成专案小组侦办，并会同高雄市环保局及高雄国税局办理联合稽查。
许萃华检察官9月22日前往现场勘验，10月27日由主任检察官陈彦竹、检察官林恒翠、蔡佩欣、薛名甫带队同步在高雄市及云林县等地共16处执行搜索，当场查扣曳引车13辆，并拘提、通知被告共19人到案。
经检察官许萃华、林恒翠、蔡佩欣、洪福临、黄莉纭、薛名甫讯问后，认王姓被告及黄姓被告违反废弃物清理法等罪，犯罪嫌疑重大，并有羁押之原因及必要性，于27 日深夜向法院声请羁押禁见，均经法院裁准。被告16人经检察官分别以最高20万元谕知交保候传。
王姓被告与黄姓被告都视公司实际负责人，却在未领有主管机关核准之废弃物清除、处理许可文件之情形下，透过自行派车及联系靠行司机相互介绍之方式，将高雄市某建筑工地之废土及营建废弃物载往高雄市大寮区上开地号农地倾倒、回填，并因而不法获利至少1500万余元。
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