甫开庭，检察官林俊廷首先就直攻行动硬碟「A1-37」。林提问，「A1-37」是何人的行动硬碟？柯文哲表示，该硬碟从他家中搜出查扣「应该是他的」，硬碟上头所贴的字条也是他的字迹，但对于该硬碟他毫无印象，应是当初作为备份用途使用；至于档案内存有几万个档案，究竟是从何时起备份的他并不清楚。
然而，柯文哲在接受检察官诘问时也频频抱怨，称检方查扣他的行动硬碟却没证据，而是用硬碟里面的资料编故事，「你们敢办镜新闻吗？骂你们唾面自干还真的唾面自干⋯」。柯自称是「档案狂」，对于硬碟内很多档案他都「不记得了」，甚至自爆已向陈佩琪确认过，家里完全没有任何金流。
顺著硬碟内容，林俊廷也追问存放于其中的Excel档案「工作簿」，柯文哲称对于「工作簿」内容没印象，自己也是在关押期间才看到，上头记载的人物不见得都认识，并称最认识的就是「邱佩琳」。只见林接续提问柯，过去与会计师范有伟、基隆市长谢国梁母亲、信义房屋创办人周俊吉妻子等人是否曾有过金钱来往？柯则数次表明「拒绝回答」。
不过，柯文哲也在与林俊廷几次攻防后，透露一些讯息。例如范有伟证称，有在家中地下室拿500万元给柯，柯回称「这是我们之间的事，他会帮忙我，但我拒绝回答」；另外，负责替周俊吉妻子募款的邱佩琳也证称，她有将周妻捐助的200万装在袋内并请柯派人来拿，柯则回称「不清楚」，直言就算现在把他抓去测谎，也还是想不起来。
其中，针对博奕教父陈盈助机要邱清章，曾前去柯文哲办公室面交300万元现金，柯表示当时募款PM为竞总主任周芳如，因此他从邱拿到钱过了1、2天后，便随即转交给周。对于这笔300万元捐款，柯坦言是看到邱作证时才想起来；检方也追问，周曾证称是由柯随行秘书许芷瑜经手转交，柯证称「是对的啦！但没有印象」。
为了追出「工作簿」由何人所做，林俊廷质疑，除了柯文哲之外，还有谁可以知道该笔资金来源是陈盈助？柯则回称不知道；林再询问，是否有用过帐户「wen」制作过档案？柯也称不清楚。似乎是难忍情绪，柯此时也再痛斥「总有一天，也要去抄民进党中央党部，看民进党帐册经不经得起考验」。
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