据《镜周刊》报导，中石化绿能科技公司为京华城大股东「中石化公司投资」成立，并于2022年议员选举捐赠2笔政治献金，分别给目前因涉京华城案收贿遭羁押禁见的北市议员应晓薇及秦慧珠，令人怀疑秦慧珠挡下停工提案的动机。
对此，她回应自己在专案报告时，有发言认同都发局长王玉芬「以缴代金方式收回20%容奖」的主张。针对搁置停工一事，秦慧珠解释，由于日前收到里长陈情，担心怕京华广场成烂尾楼，希望能续建、不要停工，而她个人也倾向发展建设。
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