疾病管制署表示，2023年流感疫苗接种计划提供家长以电子方式签署学生之流感疫苗接种意愿书，不过周三(9/13)发现系统签署意愿书所载之流感疫苗说明内容误植为去年版本，已立即请系统厂商更新为正确内容。请已经在9月13日晚上6点前完成线上签署意愿书的家长，再次登入阅读更新版说明，并重新签署。
疾管署副署长曾淑慧今日中午再度致歉，并指出今年和去年版本差异之处，第一，今年校园流感疫苗接种意愿书内容总计11项说明，比去年新增1项「接种后注意事项」。第二，「接种后注意事项」中，最大差异在于删除对鸡蛋过敏者的特别提醒。
曾淑慧解释，往年会告诉有鸡蛋过过敏史的民众，要在门诊告诉医护人员自己有鸡蛋过敏史，让熟悉处理过敏症状的医事人员提供接种服务。不过，目前研究发现，鸡蛋过敏者接种鸡胚胎制程之流感疫苗并不会影响过敏反应发生率，国际上皆建议鸡蛋过敏者可安心接种流感疫苗。也建议拿掉鸡蛋过敏者需要注意事项。
第四个今年与去年版本差异之处，在于今年公费流感疫苗共有四个厂牌，比去年新增一家高端疫苗，但公费疫苗不能选择特定厂牌，今年将提供近700万剂公费流感疫苗，依照疫苗到货顺序提供接种。
第五，接种意愿书内容其中一项会说明本季流感疫苗成分，曾淑慧说明，因为流感病毒不断变异，每年世界卫生组织都要开会讨论流感疫苗要选定的病毒株，所以去年和今年的流感疫苗成分也会不同。
曾淑慧表示，为了减少学校行政人员和家长负担，减少纸张浪费，所以将校园流感接种意愿书电子化，改为线上签署，过去两年试办，今年扩大实施，9月初才上线开放家长填写疫苗接种意愿书，新系统上线有许多需要修正的地方，会不断跟资讯人员沟通让系统更加完备。
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